Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms