Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ufd1P70362 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ufd1P70362 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ufd1P70362 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Ufd1P70362 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Ufd1P70362 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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