Protein–RNA interactions for Protein: P70343

Casp4, Caspase-4, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp4P70343 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casp4P70343 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casp4P70343 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp4P70343 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp4P70343 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms