Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb13P70321 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms