Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms