Protein–RNA interactions for Protein: P63163

Snrpn, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpnP63163 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms