Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabrb3P63080 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms