Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl23P62830 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl23P62830 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms