Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acta2P62737 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acta2P62737 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acta2P62737 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acta2P62737 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acta2P62737 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta2P62737 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta2P62737 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Acta2P62737 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acta2P62737 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acta2P62737 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acta2P62737 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms