Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps18P62270 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps18P62270 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps18P62270 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps18P62270 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps18P62270 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps18P62270 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms