Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copz1P61924 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Copz1P61924 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copz1P61924 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copz1P61924 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Copz1P61924 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms