Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga11P61622 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga11P61622 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itga11P61622 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga11P61622 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga11P61622 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga11P61622 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga11P61622 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms