Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smg6P61406 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smg6P61406 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smg6P61406 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smg6P61406 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms