Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sem1P60897 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sem1P60897 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sem1P60897 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sem1P60897 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sem1P60897 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sem1P60897 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sem1P60897 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sem1P60897 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sem1P60897 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sem1P60897 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sem1P60897 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sem1P60897 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms