Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr3bP59470 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms