Protein–RNA interactions for Protein: P59328

Wdhd1, WD repeat and HMG-box DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdhd1P59328 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Wdhd1P59328 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Wdhd1P59328 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Wdhd1P59328 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Wdhd1P59328 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Wdhd1P59328 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Wdhd1P59328 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Wdhd1P59328 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Wdhd1P59328 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Wdhd1P59328 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Wdhd1P59328 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Wdhd1P59328 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Wdhd1P59328 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Wdhd1P59328 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Wdhd1P59328 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Wdhd1P59328 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Wdhd1P59328 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Wdhd1P59328 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Wdhd1P59328 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Wdhd1P59328 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Wdhd1P59328 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Wdhd1P59328 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Wdhd1P59328 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Wdhd1P59328 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Wdhd1P59328 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Wdhd1P59328 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms