Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms