Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smpdl3bP58242 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smpdl3bP58242 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms