Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samsn1P57725 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Samsn1P57725 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samsn1P57725 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samsn1P57725 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samsn1P57725 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samsn1P57725 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samsn1P57725 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Samsn1P57725 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samsn1P57725 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samsn1P57725 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samsn1P57725 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Samsn1P57725 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Samsn1P57725 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Samsn1P57725 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Samsn1P57725 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Samsn1P57725 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Samsn1P57725 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Samsn1P57725 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Samsn1P57725 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Samsn1P57725 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Samsn1P57725 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Samsn1P57725 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Samsn1P57725 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samsn1P57725 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samsn1P57725 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samsn1P57725 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samsn1P57725 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samsn1P57725 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Samsn1P57725 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samsn1P57725 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samsn1P57725 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samsn1P57725 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samsn1P57725 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Samsn1P57725 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samsn1P57725 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samsn1P57725 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samsn1P57725 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samsn1P57725 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Samsn1P57725 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Samsn1P57725 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Samsn1P57725 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Samsn1P57725 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Samsn1P57725 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Samsn1P57725 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms