Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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