Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CdaP56389 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CdaP56389 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CdaP56389 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CdaP56389 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CdaP56389 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CdaP56389 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CdaP56389 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CdaP56389 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CdaP56389 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CdaP56389 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CdaP56389 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CdaP56389 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CdaP56389 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CdaP56389 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CdaP56389 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CdaP56389 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CdaP56389 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CdaP56389 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CdaP56389 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CdaP56389 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CdaP56389 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CdaP56389 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CdaP56389 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CdaP56389 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CdaP56389 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CdaP56389 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CdaP56389 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CdaP56389 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CdaP56389 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CdaP56389 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CdaP56389 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CdaP56389 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CdaP56389 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CdaP56389 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CdaP56389 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CdaP56389 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CdaP56389 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CdaP56389 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CdaP56389 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CdaP56389 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CdaP56389 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CdaP56389 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CdaP56389 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CdaP56389 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CdaP56389 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CdaP56389 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CdaP56389 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CdaP56389 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CdaP56389 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CdaP56389 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CdaP56389 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CdaP56389 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CdaP56389 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CdaP56389 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CdaP56389 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CdaP56389 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CdaP56389 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CdaP56389 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CdaP56389 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CdaP56389 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CdaP56389 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CdaP56389 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CdaP56389 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CdaP56389 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CdaP56389 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CdaP56389 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CdaP56389 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CdaP56389 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CdaP56389 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CdaP56389 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CdaP56389 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CdaP56389 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CdaP56389 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CdaP56389 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CdaP56389 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CdaP56389 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CdaP56389 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CdaP56389 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CdaP56389 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CdaP56389 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CdaP56389 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CdaP56389 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CdaP56389 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CdaP56389 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CdaP56389 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CdaP56389 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CdaP56389 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CdaP56389 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CdaP56389 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CdaP56389 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CdaP56389 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CdaP56389 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CdaP56389 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CdaP56389 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CdaP56389 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CdaP56389 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CdaP56389 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CdaP56389 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CdaP56389 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms