Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GemP55041 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GemP55041 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GemP55041 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GemP55041 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GemP55041 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GemP55041 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GemP55041 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GemP55041 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GemP55041 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GemP55041 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GemP55041 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GemP55041 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GemP55041 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GemP55041 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GemP55041 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GemP55041 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GemP55041 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GemP55041 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GemP55041 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GemP55041 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GemP55041 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GemP55041 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GemP55041 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GemP55041 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GemP55041 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GemP55041 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GemP55041 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GemP55041 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GemP55041 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GemP55041 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GemP55041 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GemP55041 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GemP55041 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GemP55041 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GemP55041 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GemP55041 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GemP55041 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GemP55041 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GemP55041 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GemP55041 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GemP55041 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GemP55041 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GemP55041 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GemP55041 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GemP55041 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GemP55041 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GemP55041 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GemP55041 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GemP55041 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GemP55041 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GemP55041 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GemP55041 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GemP55041 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GemP55041 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GemP55041 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GemP55041 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GemP55041 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GemP55041 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GemP55041 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GemP55041 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GemP55041 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GemP55041 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GemP55041 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GemP55041 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GemP55041 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GemP55041 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GemP55041 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GemP55041 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GemP55041 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GemP55041 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GemP55041 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GemP55041 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GemP55041 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GemP55041 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GemP55041 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GemP55041 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GemP55041 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GemP55041 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GemP55041 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GemP55041 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GemP55041 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GemP55041 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GemP55041 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GemP55041 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GemP55041 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GemP55041 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GemP55041 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GemP55041 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GemP55041 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GemP55041 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GemP55041 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GemP55041 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GemP55041 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GemP55041 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GemP55041 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GemP55041 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GemP55041 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GemP55041 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GemP55041 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms