Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms