Protein–RNA interactions for Protein: P52793

Efna1, Ephrin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna1P52793 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna1P52793 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna1P52793 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna1P52793 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna1P52793 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna1P52793 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna1P52793 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna1P52793 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms