Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms