Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms