Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms