Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa8P50706 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa8P50706 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa8P50706 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa8P50706 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa8P50706 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa8P50706 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa8P50706 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa8P50706 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa8P50706 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa8P50706 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa8P50706 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms