Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TspoP50637 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TspoP50637 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TspoP50637 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TspoP50637 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TspoP50637 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TspoP50637 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TspoP50637 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TspoP50637 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TspoP50637 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TspoP50637 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TspoP50637 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TspoP50637 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TspoP50637 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TspoP50637 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TspoP50637 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TspoP50637 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TspoP50637 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TspoP50637 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TspoP50637 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TspoP50637 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TspoP50637 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TspoP50637 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TspoP50637 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TspoP50637 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TspoP50637 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TspoP50637 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TspoP50637 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TspoP50637 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TspoP50637 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TspoP50637 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TspoP50637 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TspoP50637 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TspoP50637 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TspoP50637 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TspoP50637 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TspoP50637 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TspoP50637 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TspoP50637 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TspoP50637 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TspoP50637 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TspoP50637 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TspoP50637 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TspoP50637 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TspoP50637 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TspoP50637 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TspoP50637 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TspoP50637 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TspoP50637 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TspoP50637 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TspoP50637 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TspoP50637 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TspoP50637 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TspoP50637 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TspoP50637 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TspoP50637 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TspoP50637 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TspoP50637 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TspoP50637 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TspoP50637 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TspoP50637 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TspoP50637 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TspoP50637 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TspoP50637 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TspoP50637 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TspoP50637 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TspoP50637 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TspoP50637 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TspoP50637 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TspoP50637 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TspoP50637 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TspoP50637 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TspoP50637 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TspoP50637 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TspoP50637 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TspoP50637 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TspoP50637 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TspoP50637 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TspoP50637 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TspoP50637 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TspoP50637 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TspoP50637 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TspoP50637 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TspoP50637 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TspoP50637 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TspoP50637 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TspoP50637 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TspoP50637 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TspoP50637 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TspoP50637 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TspoP50637 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TspoP50637 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TspoP50637 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TspoP50637 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TspoP50637 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TspoP50637 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TspoP50637 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TspoP50637 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TspoP50637 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TspoP50637 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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