Protein–RNA interactions for Protein: P49615

Cdk5, Cyclin-dependent-like kinase 5, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5P49615 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdk5P49615 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms