Protein–RNA interactions for Protein: P47968

Rpia, Ribose-5-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpiaP47968 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RpiaP47968 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RpiaP47968 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpiaP47968 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpiaP47968 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpiaP47968 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpiaP47968 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpiaP47968 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpiaP47968 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpiaP47968 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpiaP47968 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpiaP47968 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpiaP47968 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpiaP47968 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpiaP47968 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpiaP47968 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpiaP47968 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpiaP47968 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpiaP47968 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpiaP47968 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpiaP47968 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpiaP47968 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpiaP47968 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpiaP47968 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpiaP47968 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpiaP47968 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpiaP47968 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RpiaP47968 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpiaP47968 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpiaP47968 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpiaP47968 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpiaP47968 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpiaP47968 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RpiaP47968 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RpiaP47968 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RpiaP47968 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpiaP47968 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpiaP47968 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpiaP47968 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpiaP47968 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms