Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrprbP47758 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrprbP47758 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SrprbP47758 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SrprbP47758 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms