Protein–RNA interactions for Protein: P46660

Ina, Alpha-internexin, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InaP46660 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
InaP46660 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
InaP46660 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
InaP46660 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
InaP46660 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
InaP46660 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
InaP46660 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
InaP46660 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
InaP46660 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
InaP46660 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
InaP46660 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
InaP46660 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
InaP46660 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
InaP46660 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
InaP46660 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
InaP46660 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
InaP46660 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
InaP46660 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
InaP46660 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
InaP46660 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
InaP46660 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
InaP46660 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
InaP46660 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
InaP46660 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
InaP46660 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
InaP46660 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
InaP46660 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
InaP46660 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
InaP46660 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
InaP46660 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
InaP46660 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
InaP46660 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
InaP46660 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
InaP46660 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
InaP46660 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
InaP46660 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
InaP46660 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
InaP46660 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
InaP46660 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
InaP46660 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
InaP46660 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
InaP46660 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
InaP46660 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
InaP46660 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
InaP46660 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
InaP46660 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
InaP46660 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
InaP46660 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
InaP46660 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
InaP46660 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
InaP46660 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
InaP46660 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
InaP46660 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
InaP46660 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
InaP46660 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
InaP46660 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
InaP46660 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
InaP46660 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
InaP46660 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
InaP46660 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
InaP46660 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
InaP46660 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
InaP46660 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
InaP46660 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
InaP46660 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
InaP46660 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
InaP46660 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
InaP46660 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
InaP46660 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
InaP46660 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
InaP46660 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
InaP46660 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
InaP46660 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
InaP46660 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
InaP46660 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
InaP46660 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
InaP46660 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
InaP46660 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
InaP46660 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
InaP46660 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
InaP46660 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
InaP46660 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
InaP46660 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
InaP46660 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
InaP46660 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
InaP46660 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
InaP46660 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
InaP46660 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
InaP46660 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
InaP46660 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
InaP46660 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
InaP46660 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
InaP46660 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
InaP46660 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
InaP46660 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
InaP46660 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
InaP46660 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
InaP46660 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
InaP46660 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
InaP46660 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms