Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syt1P46096 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syt1P46096 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syt1P46096 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syt1P46096 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syt1P46096 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syt1P46096 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms