Protein–RNA interactions for Protein: P43241

Cdx2, Homeobox protein CDX-2, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx2P43241 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdx2P43241 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms