Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gdf5P43027 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gdf5P43027 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gdf5P43027 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gdf5P43027 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gdf5P43027 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gdf5P43027 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gdf5P43027 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gdf5P43027 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gdf5P43027 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gdf5P43027 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gdf5P43027 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gdf5P43027 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gdf5P43027 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gdf5P43027 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gdf5P43027 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gdf5P43027 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gdf5P43027 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gdf5P43027 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gdf5P43027 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gdf5P43027 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gdf5P43027 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gdf5P43027 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gdf5P43027 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gdf5P43027 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gdf5P43027 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gdf5P43027 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gdf5P43027 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gdf5P43027 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gdf5P43027 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gdf5P43027 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gdf5P43027 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gdf5P43027 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gdf5P43027 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gdf5P43027 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gdf5P43027 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gdf5P43027 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gdf5P43027 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gdf5P43027 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gdf5P43027 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gdf5P43027 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gdf5P43027 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms