Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms