Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tac1P41539 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tac1P41539 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tac1P41539 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms