Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ThpoP40226 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ThpoP40226 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ThpoP40226 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ThpoP40226 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ThpoP40226 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ThpoP40226 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms