Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csf3rP40223 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Csf3rP40223 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csf3rP40223 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Csf3rP40223 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csf3rP40223 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csf3rP40223 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csf3rP40223 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csf3rP40223 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csf3rP40223 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csf3rP40223 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csf3rP40223 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csf3rP40223 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csf3rP40223 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csf3rP40223 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csf3rP40223 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csf3rP40223 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csf3rP40223 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Csf3rP40223 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csf3rP40223 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csf3rP40223 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csf3rP40223 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csf3rP40223 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csf3rP40223 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csf3rP40223 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csf3rP40223 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csf3rP40223 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csf3rP40223 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csf3rP40223 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Csf3rP40223 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Csf3rP40223 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms