Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf2P39429 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf2P39429 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf2P39429 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf2P39429 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf2P39429 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf2P39429 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf2P39429 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf2P39429 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf2P39429 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms