Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk2P38575 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upk2P38575 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk2P38575 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk2P38575 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk2P38575 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk2P38575 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms