Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptk2P34152 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms