Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms