Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pola1P33609 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pola1P33609 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pola1P33609 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pola1P33609 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pola1P33609 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pola1P33609 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pola1P33609 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms