Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms