Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms