Protein–RNA interactions for Protein: P29268

Ctgf, Connective tissue growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtgfP29268 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtgfP29268 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CtgfP29268 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtgfP29268 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CtgfP29268 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CtgfP29268 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtgfP29268 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms