Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RxraP28700 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RxraP28700 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RxraP28700 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RxraP28700 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RxraP28700 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RxraP28700 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RxraP28700 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RxraP28700 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RxraP28700 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RxraP28700 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RxraP28700 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RxraP28700 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RxraP28700 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RxraP28700 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RxraP28700 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RxraP28700 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RxraP28700 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RxraP28700 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RxraP28700 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RxraP28700 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RxraP28700 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RxraP28700 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RxraP28700 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RxraP28700 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RxraP28700 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RxraP28700 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RxraP28700 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RxraP28700 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RxraP28700 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RxraP28700 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RxraP28700 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RxraP28700 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RxraP28700 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RxraP28700 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RxraP28700 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RxraP28700 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RxraP28700 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RxraP28700 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RxraP28700 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RxraP28700 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RxraP28700 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RxraP28700 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RxraP28700 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RxraP28700 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RxraP28700 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RxraP28700 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RxraP28700 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RxraP28700 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RxraP28700 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RxraP28700 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RxraP28700 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RxraP28700 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RxraP28700 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RxraP28700 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RxraP28700 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RxraP28700 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RxraP28700 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RxraP28700 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RxraP28700 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RxraP28700 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RxraP28700 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RxraP28700 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RxraP28700 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RxraP28700 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RxraP28700 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RxraP28700 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RxraP28700 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RxraP28700 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RxraP28700 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RxraP28700 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RxraP28700 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RxraP28700 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RxraP28700 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RxraP28700 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RxraP28700 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
RxraP28700 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RxraP28700 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RxraP28700 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RxraP28700 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RxraP28700 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RxraP28700 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RxraP28700 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RxraP28700 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RxraP28700 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RxraP28700 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RxraP28700 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RxraP28700 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RxraP28700 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RxraP28700 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RxraP28700 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RxraP28700 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RxraP28700 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RxraP28700 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RxraP28700 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RxraP28700 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RxraP28700 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RxraP28700 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RxraP28700 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RxraP28700 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms