Protein–RNA interactions for Protein: P28667

Marcksl1, MARCKS-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marcksl1P28667 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Marcksl1P28667 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Marcksl1P28667 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Marcksl1P28667 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Marcksl1P28667 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Marcksl1P28667 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Marcksl1P28667 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Marcksl1P28667 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Marcksl1P28667 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Marcksl1P28667 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Marcksl1P28667 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Marcksl1P28667 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Marcksl1P28667 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Marcksl1P28667 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Marcksl1P28667 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms